AWI heeft een uitgebreid netwerk waarmee de organisatie samenwerkt. In Somalië is er het netwerk van clusters dat gecoördineerd wordt door UNOCHA. Binnen dit netwerk is AWI lid van de Food Security Cluster, WASH Cluster, Protection Cluster en Nutrition Cluster.
Naast de cluster heeft AWI ook een nauw samenwerkingsverband met Yme, een Noorse NGO met focus op water, voedselzekerheid en inkomen.
Verder heeft AWI een overeenkomt met Dibcoop in Wageningen waarmee samen projecten worden ontwikkeld.
